2008-09 Sezonunda liglerden yükselen ve düşen takımlar nerdeyse tamamıyla belli oldu.
Bir alt kümeden bir üst kümeye yükselen takım sayısı 18.
Amatör'den 3. Lig'e yükselenler: Çerkezköy Belediye, Bayrampaşa, Muğla, Tekirova Belediye, Yalı ve 3 haziranda belli olacak olan Yüksekova/Pansu Şeker-Kırıkhan/Önder takımlarından biri.
3. Lig'den 2. Lig'e yükselenler: KAHRAMANMARAŞSPOR, Göztepe, Tepecik Belediye, Tavşanlı Linyit, Pursaklar ve Yalova.
2. Lig'den 1. Lig'e yükselenler: Buca, Mersin İdman Yurdu ve Dardanel.
1. Lig'den Süper Lig'e yükselenler: Manisa, Diyarbakır ve Kasımpaşa.
Öte yandan profesyonel liglerden toplam 31 takım bir alt kümeye düştü.
3. Lig'den amatöre düşenler: Orhangazi Gençlerbirliği, Fatih Karagümrük, Aydın, Mustafakemalpaşa, Aksaray, Uşak, Erzincan, DÇ Divriği, Bağlar Vural ve Kilis Belediye.
2. Lig'den 3. Lig'e düşenler: Gaziosmanpaşa, Darıca Gençlerbirliği, Beylerbeyi, Altınordu, Marmaris Belediye, Afyonkarahisar, MKE Kırıkkale, Maltepe, Alibeyköy, Pazar, Arsin, Yimpaş Yozgat, GASKİ, Urfa Belediye ve Malatya Belediye.
1. Lig'den 2. Lig'e düşenler: Sakarya, Güngören Belediye ve Malatya.
Süper Lig'den 1. Lig'e düşenler: Konya, Kocaeli ve Hacettepe.